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頂科現(xiàn)場|金力院士:建全球性“表型組銀行”來探索人類身體系統(tǒng)

中國科學(xué)院院士、復(fù)旦大學(xué)校長金力 微博@復(fù)旦大學(xué) 資料圖
·“人類的表型組研究就像開車時用導(dǎo)航來進行道路的探索一樣,我們希望通過建立一個基因組網(wǎng)絡(luò)來探索不同表型之間的關(guān)聯(lián),從而探索復(fù)雜的人類身體系統(tǒng)。這是之前僅看單個表型所不能解決的?!?/u>
“我們希望在現(xiàn)有的表型組圖譜中納入更多類型的人,建立一個全球性的表型組銀行,來促進疾病研究和預(yù)防。” 11月3日,在上海科學(xué)會堂舉辦的第五屆世界頂尖科學(xué)家論壇——多組學(xué)時代與精準醫(yī)學(xué)分論壇上,中國科學(xué)院院士、復(fù)旦大學(xué)校長金力在題為“面向人類表型組圖譜”的演講中說道。
金力院士是進化遺傳學(xué)家,長期研究人類群體的遺傳多樣性和人類性狀的進化機制。在這場演講中,他介紹了他的團隊正在進行的人類表型組圖譜工作。“人類的表型組研究就像開車時用導(dǎo)航來進行道路的探索一樣,我們希望通過建立一個基因組網(wǎng)絡(luò)來探索不同表型之間的關(guān)聯(lián),從而探索復(fù)雜的人類身體系統(tǒng)。這是之前僅看單個表型所不能解決的。”金力說。
他介紹,建立表型組圖譜要從多方面進行考慮,國際性、表型組平臺和SOP標準操作方法非常重要。
首先要考慮其國際性,“全世界不同地方的人有不同的差異,也有很多的共性,建立人類表型組圖譜需要納入更多不同國家和地區(qū)的人,以進行更多的探索?!苯鹆φf。為了探索盡可能多的表型組,需要建立起表型組平臺。過去三年,金力團隊已經(jīng)建立了包括蛋白質(zhì)組、代謝組、表觀基因組等在內(nèi)的表型組平臺,目前已經(jīng)收集了涵蓋23個種類,超過24000種不同表型的數(shù)據(jù)。
SOP標準操作方法也非常重要,它可以確保國際層面上不同實驗室之間的數(shù)據(jù)可以相互比較。金力團隊和全世界幾個不同的實驗室合作,現(xiàn)已整理出深度表型的標準操作程序,他們已經(jīng)招募超過4000名志愿者,其中超過1000多人的表型得以記錄。為了讓這些數(shù)據(jù)變得有意義,他們還建立了數(shù)據(jù)的標準,即“常見數(shù)據(jù)類型”。
目前,金力團隊已建立起表型網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng),通過該網(wǎng)絡(luò),每個人具有的24000多種不同表型能產(chǎn)生可比較的6個億的數(shù)據(jù)量,研究人員已經(jīng)在其中找到了150萬個表型之間的強關(guān)聯(lián)。
有了表型網(wǎng)絡(luò)之后,怎么把它和人類基因表型圖譜連在一起?金力舉了幾個例子,“我們觀察到抑郁癥和睡眠的表型之間有很高的相關(guān)性;免疫細胞軌跡的聚集可以顯示在衰老過程中的線性和非線性的變化,我們對免疫系統(tǒng)在整個生命期的變化進行量化,發(fā)現(xiàn)在人類的生命中有兩個時期發(fā)生了快速變化,一個是30-40歲,另一個是60歲,因此我們可以建立人類免疫模型來量化免疫衰老;我們還對代謝組進行研究,嘗試探索預(yù)防老年癡呆癥的方法。”
金力稱,下一步,他們會將表型組圖譜推進到2.0時代——建立一個全球表型組銀行,納入更多類型的人口,增加總體表型的數(shù)量,并做更多的隨訪研究。他表示,這個表型組學(xué)可以用于疾病的研究和預(yù)防、健康管理等。在此過程中,國際合作是必不可少的。





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