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追問|“不可成藥”靶點被攻克了?《科學(xué)》展示小分子藥新策略

澎湃新聞記者 姚易琪
2023-08-19 08:18
來源:澎湃新聞
? 生命科學(xué) >
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·“很多年前科學(xué)家就開始了對不可成藥靶點的研究,也有很多類似藥物進入了臨床試驗階段。雖然這項研究的概念和手段不算是原創(chuàng),但是要實現(xiàn)這樣的結(jié)果,特別是針對一個突變蛋白的激活態(tài),其實需要經(jīng)過大量深入嚴謹?shù)墓ぷ鳌!?/u>

當(dāng)?shù)貢r間8月17日,《科學(xué)》(Science)雜志發(fā)文稱,美國精準(zhǔn)腫瘤學(xué)醫(yī)藥企業(yè)Revolution Medicines和紀念斯隆-凱特琳癌癥中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Cente)的科學(xué)團隊展示了使用小分子藥物靶向“不可成藥”靶點的新策略。

KRAS蛋白曾經(jīng)是著名的“不可成藥”靶點。在這項研究中,科學(xué)家們試圖開發(fā)針對激活狀態(tài)的KRAS G12C突變體的抑制劑。最終,他們開發(fā)了基于化合物RMC-4998的激活態(tài)KRAS G12C分子膠抑制劑——RMC-6291。

目前,RMC-6291已進入1/1b期臨床試驗,正在攜帶KRAS G12C突變體的實體瘤患者中評估其安全性并進行劑量優(yōu)化,最初的研究將聚焦于非小細胞肺癌患者,并可能包括結(jié)直腸癌患者。

在本次實驗中,研究人員將注意力放在一個名為CYPA的分子伴侶蛋白上,CYPA最初作為免疫抑制藥物環(huán)孢菌素A(cyclosporin A)的受體被發(fā)現(xiàn)。它與環(huán)孢菌素A結(jié)合之后,能夠與鈣調(diào)磷酸酶(calcineurin)形成復(fù)合體并抑制磷酸酶活性。有趣的是,CYPA或環(huán)孢菌素A并不能獨自與鈣調(diào)磷酸酶結(jié)合。這一作用揭示了分子膠的作用機制——小分子藥物可以將兩個原本沒有相互作用的蛋白拉到一起來產(chǎn)生活性。

基于這一發(fā)現(xiàn),研究團隊嘗試對與CYPA結(jié)合的天然產(chǎn)物進行改造,經(jīng)過多輪基于結(jié)構(gòu)的化合物優(yōu)化,研究人員發(fā)現(xiàn)了名為RMC-4998的候選分子膠化合物。

論文作者指出,CYPA與激活狀態(tài)下KRAS G12C突變體結(jié)合的界面包含了多個氨基酸之間的相互作用,這種作用機制讓分子膠藥物能以更高的選擇性靶向抑制KRAS G12C的活性。而且,由于分子膠介導(dǎo)的相互作用,藥效更不容易因為KRAS G12C或CYPA蛋白上出現(xiàn)的基因突變而受到抑制,這意味著針對RMC-4998和RMC-6291的耐藥性突變更難產(chǎn)生,因此它們在臨床應(yīng)用中可能表現(xiàn)出更持久的療效。

同期發(fā)布的評論文章指出,這種結(jié)合結(jié)構(gòu)生物學(xué)、理性設(shè)計和醫(yī)藥化學(xué)的設(shè)計方法,與高通量篩選相結(jié)合,有望更快開發(fā)分子膠療法,靶向多種“不可成藥”靶點。

這并非醫(yī)學(xué)界第一次打破KRAS不可成藥“魔咒”。此前,科學(xué)家曾發(fā)現(xiàn)KRAS G12C突變體的半胱氨酸可以被共價小分子藥物靶向,這一突破最終帶來了美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準(zhǔn)的兩款KRAS抑制劑——sotorasib和adagrasib,用于治療至少接受過一種前期全身治療的KRAS G12C突變非小細胞肺癌(NSCLC)患者,不過這些抑制劑均靶向KRAS G12C突變體的失活狀態(tài),而且患者可能在接受治療后產(chǎn)生耐藥性。

在清華大學(xué)、比爾及梅琳達·蓋茨基金會和北京市政府共同發(fā)起成立的獨立運營、非營利性全球公共衛(wèi)生與藥物創(chuàng)新機構(gòu)——全球健康藥物研發(fā)中心(GHDDI)主任、清華大學(xué)藥學(xué)院創(chuàng)院院長丁勝看來,此項研究的意義在于工作量大、投入大,研究手段嚴謹深入?!捌鋵嵑芏嗄昵翱茖W(xué)家就開始了對不可成藥靶點的研究,也有很多類似藥物進入了臨床試驗階段。雖然這項研究的概念和手段不算是原創(chuàng),但是要實現(xiàn)這樣的結(jié)果,特別是針對一個突變蛋白的激活態(tài),其實需要經(jīng)過大量深入嚴謹?shù)墓ぷ??!倍俦硎?,實際上并非所有分子設(shè)計都能做到概念和手段都十分清晰,這就需要不斷做出調(diào)整和更改,且該實驗由制藥公司牽頭主導(dǎo),所以投入比一般學(xué)校的實驗室更多。

美國阿拉巴馬大學(xué)伯明翰分校遺傳學(xué)博士周葉斌向澎湃科技解釋,傳統(tǒng)小分子藥物往往是直接激活或抑制一個蛋白質(zhì),這只能適用于部分靶點,也就帶來了“不可成藥靶點”的概念。KRAS是經(jīng)典的不可成藥靶點,因為它作為一個激酶和底物,結(jié)合能力非常強,傳統(tǒng)小分子根本沒法插足。但KRAS G12C的突變,讓KRAS出現(xiàn)了傳統(tǒng)小分子能成藥的氨基酸位點,這也是多個現(xiàn)在上市以及在研的KRAS藥物的成藥機理。不過,周葉斌也表示,這仍然是一種偶然獲得的成藥可能。要讓更多不可成藥靶點成藥,就需要超越傳統(tǒng)小分子制藥技術(shù)。

據(jù)周葉斌介紹,現(xiàn)在比較熱門的技術(shù)有兩種,一種是PROTAC雙頭分子,它一頭和靶點結(jié)合,另一頭和降解蛋白質(zhì)的蛋白酶結(jié)合,能專門把某個蛋白降解掉,而不需要小分子直接抑制某個蛋白。另一種就是此實驗中采用的分子膠技術(shù),這類小分子可以把兩個蛋白結(jié)合起來,產(chǎn)生新的作用。比如在此研究中,分子膠把KRAS和另一種蛋白綁在一起,就阻斷了KRAS本身的功能。

“PROTAC和分子膠目前都還在驗證階段。最缺一個成功藥物來證實這兩個技術(shù)的可行性和有效性。同時,從應(yīng)用前景來說,這類新技術(shù)都可以看作一種全新的制藥方式,如果能有一個藥物驗證成功,就有可能打開一個全新的制藥方法,也能幫助我們大概確定適合這些技術(shù)的靶點特征,會大大擴展?jié)撛诘男滤幯邪l(fā)可能?!敝苋~斌說。

    責(zé)任編輯:盧雁
    圖片編輯:樂浴峰
    校對:張艷
    澎湃新聞報料:021-962866
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