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各國到底何時起出現(xiàn)新冠病毒感染
原創(chuàng) 史雋 返樸 來自專輯117三人行 | 專欄目錄
回顧性研究一樣需要嚴謹?shù)恼{(diào)研才能得出可靠的結(jié)論?!凹訇幮浴薄凹訇栃浴焙退剖嵌堑牟聹y只會把水越攪越渾。
撰文 | 史雋
新冠病毒的傳播幾乎已經(jīng)遍布全世界,已經(jīng)有215個國家和地區(qū)有確診病例。
很多國家都開始對過去保存的舊樣品進行測試,試圖追溯新冠病毒到底是什么時候開始出現(xiàn)在本地的。今天我們就總結(jié)一下這些發(fā)現(xiàn),以及每個發(fā)現(xiàn)到底意味著什么。
美國西雅圖
西雅圖(華盛頓州)的發(fā)現(xiàn)來自于Seattle flu project (西雅圖流感計劃)[1]。
這個研究計劃始于2018年,最初意在收集有流感癥狀的西雅圖地區(qū)居民的鼻拭子樣本,進行檢測分析,從而更詳盡地了解流感病毒的傳播方式。因此,這一計劃保存了很多西雅圖地區(qū)有急性呼吸道感染的人的鼻拭子樣本。這些人中一部分有流感樣疾病,如果是新冠病毒感染,也會因為癥狀符合條件被采樣。
2月底,西雅圖新冠肺炎暴發(fā)以后,參與西雅圖流感計劃的研究人員回去檢測了以前凍存的樣本里是不是有新冠病毒。
結(jié)果顯示:
在2020年1月份收集的3600個樣本里面0個是新冠病毒。
在2月份收集的3308個樣本里面,最早的新冠樣本在2月21日被采集到,之后總共有10個樣本是新冠測試陽性。這個故事我在以前一篇日記里面特地講過 (見《117疫情觀察:新冠無癥狀感染的威脅 | 史雋·Ⅲ》)。
此外,2019年10月到2020年2月的樣本里面有各種各樣的病毒,包括流感病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、間質(zhì)肺病毒和普通的季節(jié)性冠狀病毒 (包括4種:229E、NL63、OC43和HKU1)。
引起普通感冒最多的病毒是鼻病毒 (rhinovirus),而排在第二位的就是普通的季節(jié)性冠狀病毒(約占所有感冒的15-30%)。
普通的冠狀病毒在核酸檢測法中很容易與新冠病毒區(qū)分開,沒有混淆的可能性,這個發(fā)現(xiàn)還是很嚴謹?shù)摹?/p>
美國加州
2020年4月21日,美國加州宣布通過“開棺驗尸”發(fā)現(xiàn)了一個2月初新冠病毒死亡的病例。死者是美國加州硅谷的一位57歲女性,名叫帕特里夏·多德(Patricia Dowd)。
多德在一家跨國半導(dǎo)體公司工作,公司在世界各地都設(shè)有辦事處。她作為審計師,需要接觸來自世界各地的員工,并經(jīng)常需要出差。2019年11月,她曾去北京出差。
2020年2月2日,多德出現(xiàn)流感癥狀。四天后 (2月6日),她仍然覺得不舒服,在家工作。等到她女兒回家后,發(fā)現(xiàn)她倒在廚房的早餐吧臺邊,已經(jīng)死亡。多德的流感測試為陰性,尸檢發(fā)現(xiàn)似乎是嚴重的心臟病發(fā)致死,但是什么原因?qū)е碌牟⒉磺宄2]。
新冠肺炎在加州暴發(fā)以后,她居住的加州圣克拉拉縣 (Santa Clara) 的衛(wèi)生官員決定,重新調(diào)查該縣十多例原因不明的死亡。
3月中旬,多德的凍存組織樣本被送到亞特蘭大的CDC進行進一步檢查,4月21日核酸檢測結(jié)果公布,證實她感染了新冠病毒。美國CDC的科學(xué)家們正試圖對分離的病毒RNA進行測序,與已經(jīng)共享的序列進行比較,分析和其他病例的潛在聯(lián)系。怎樣用測序大法來進行流調(diào),在以前的一篇日記里介紹過 (《117疫情觀察:詳解病毒基因序列追蹤流調(diào)大法 | 史雋·Ⅶ》)。
可惜,從死亡組織里分離出的病毒RNA,要測序不是件容易的事。全基因組測序?qū)NA的質(zhì)量要求比較高,需要較長的、幾乎沒有斷裂的RNA。到目前為止,CDC的科學(xué)家們僅獲得了相對較短的RNA,雖然用來做RT-PCR確診足夠了,但還不足以用來做全基因組測序。
此外,圣塔克拉拉縣2月17日和3月6日發(fā)生的兩例死亡事件,早先認為沒有關(guān)聯(lián),現(xiàn)在也被確認與新冠病毒有關(guān)。這比之前加州公布的首例社區(qū)傳播病例(2月26日)更提前了。
新冠病毒的潛伏期長達14天,在出現(xiàn)癥狀之前,就已經(jīng)可能具有傳染性。多德在2月6日死亡之前已經(jīng)病了幾天,所以她很可能最早在一月份就將病毒傳染給了其他人。
2020年4月,加州州長加文·紐瑟姆(Gavin Newsom)宣布,一些地區(qū)的研究人員正在追溯2019年12月的驗尸和尸檢報告,看是否有更早的新冠病毒感染致死的病例。
美國新澤西
2020年4月30日,美國新澤西州貝爾維爾市的市長提出了一個令人震驚但未經(jīng)證實的說法,說自己在2019年11月就感染了新冠病毒[3]。
市長邁克爾·梅勒姆(Michael Melham)說,在最近的常規(guī)體檢幾天后,他要求家庭醫(yī)生檢查血液中是否存在新冠病毒抗體。4月29日,他得到了肯定的結(jié)果:他血液里檢測到了IgG亞型的新冠抗體。
他回憶自己4個月前在大西洋城參加新澤西市政聯(lián)盟會議時生病了。2019年11月21日開完會回到家后,癥狀惡化,發(fā)燒到38.9°C,身上發(fā)冷,出現(xiàn)幻覺和喉嚨痛,但沒有新冠肺炎常見的呼吸急促或困難。他電話咨詢了醫(yī)生,醫(yī)生診斷為嚴重的流感。
然而,梅勒姆“認為”那時候他應(yīng)該是感染了新冠肺炎。
梅勒姆一個人住,除了1月下旬曾去過波多黎各的旅行外,最近幾個月都沒有旅行。他也沒有打流感疫苗。
然而,除了梅勒姆自己的陳述,新澤西州的衛(wèi)生官員并沒有確認他說的是否屬實。
梅勒姆的猜測從科學(xué)上講很不嚴謹,有兩個大問題:
1) 他的抗體檢測結(jié)果并不一定是正確的。
他的家庭醫(yī)生不知道使用的是哪個廠家的抗體試劑盒。市面上很多抗體試劑盒的準確率很低,有些甚至?xí)鸵鹌胀竟?jié)性感冒的冠狀病毒反應(yīng),得出陽性結(jié)果。
前一段時間,瑞士羅氏 (Roche) 制藥公司的CEO就公開批評市面上充斥了許多不靠譜的新冠抗體試劑盒,這些試劑盒的假陽性和假陰性率都非常高。他認為這些試劑盒:
“
一文不值(These tests are not worth anything, or have very little use)
有些公司很沒有職業(yè)道德地推出了(不靠譜的)產(chǎn)品(Some of these companies, I tell you, this is ethically very questionable to get out with this stuff,)
任何非專業(yè)人員都可以做出一個抗體試劑盒……我們兩個在車庫里用一晚上時間就能做出一個來。(Every kind of amateur could produce an antibody test…The two of us could do it overnight in the garage.)

2) 即使他的抗體檢測陽性結(jié)果是正確的,也無法確認他到底是什么時候感染的新冠病毒。11月份的生病很可能只是流感或者感冒,而真正的新冠感染反而是輕癥或者無癥狀。
抗體測試通常是檢測兩種類型的抗體:IgM和IgG。IgM抗體通常在感染后約一個星期內(nèi)產(chǎn)生,這個時候患者可能還帶毒。隨后人體會產(chǎn)生另一種稱為IgG的抗體,IgM水平會隨之減弱。IgG抗體可以持續(xù)更長的時間,甚至感染過后,IgG抗體還會留在血液中一段時間。然而,新冠病毒 (SARS-CoV-2) 被人體清除后, IgM或IgG的抗體會在體內(nèi)保留多長時間還不清楚。圖2顯示了SARS冠狀病毒 (SARS-CoV-1) 的抗體在體內(nèi)出現(xiàn)和存留的時間。這里要提醒大家,不同的病毒引起的免疫反應(yīng)都會不同,圖2只是一個參考。圖3是根據(jù)目前發(fā)表的數(shù)據(jù)來預(yù)測新冠病毒的不同檢測方法所適用的時間段。


好的抗體測試盒需要有:
1) 高靈敏度:可以檢測各種各樣識別不同病毒蛋白片段的IgM或IgG抗體。如果敏感度不高,就會造成假陰性。
2) 高特異性:只檢測到針對新冠病毒的抗體,排除針對別的病毒的抗體。
這兩點非常重要??贵w經(jīng)常會有非特異性的識別,這就會造成假陽性結(jié)果。例如,引起普通感冒的季節(jié)性冠狀病毒也在全球傳播,如果一個抗體的靈敏度高而特異性低,就可能會識別出這些普通感冒病毒的抗體,導(dǎo)致假陽性結(jié)果。
什么時候做抗體檢測也很關(guān)鍵。剛感染病毒的患者,體內(nèi)抗體還沒有產(chǎn)生,結(jié)果就會是陰性。如果在恢復(fù)很長時間后檢測,抗體濃度會隨著時間的推移而降低,甚至消失,結(jié)果也可能是陰性。
最后,每個人感染以后的反應(yīng)不同,有些人產(chǎn)生抗體的能力不強。結(jié)果,一部分人雖然感染過病毒,卻檢測不到抗體。
盡管市面上充斥了許多良莠不齊的新冠病毒抗體試劑盒,截至5月24日,美國FDA僅授權(quán)12種用于緊急使用。根據(jù)生產(chǎn)商提供給FDA的數(shù)據(jù),不同試劑盒的敏感度 (88%到100%)和特異性 (90%到100%)的差別很大。
文章已于修改
原標(biāo)題:《開棺驗尸:各國到底何時起出現(xiàn)新冠病毒感染 | 117疫情觀察》
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